08-08-4至08-08-5上海
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臻和科技与上海市肺科医院周彩存教授团队合作的项研究全部入选为08WCLC口头汇报! 来源: 罗辑医疗

研究方法:9例肺癌脑转移和匹配淋巴结样本进行全外显子组深度测序(平均>50乘),以外周血细胞作为正常生殖系对照。

中国肺鳞癌人群基因组突变特征及其与TMB,CD8+ TIL和PD-L表达关联分析

研究背景:本研究旨在全面描绘中国肺鳞癌人群基因组突变特征及其与TMB, CD8+ TIL和PD-L表达的关系

研究方法:89例中国肺鳞癌样本进行全外显子组测序,高TMB定义为大于总体的75%分位数,CD8+ TIL 和PD-L的表达通过IHC检测,阳性cutoff值均定义为>5%。

研究结果:共有8个高频突变基因被发现,包括TP5, KMTC, NFEL, KEAP, CDKNA, PTEN, FBXW7 和 PIKCA。其中FGFR和PIKCA的扩增比率分别为9%和%。除吸烟史外,基线特征资料与TMB表达无关。FGFR, PIKCA 或 SOX的扩增与更高的TMB相关。PD-L和CD8+ TIL阳性率分别为4.%和78.8%。NFEL 突变和 PIKCA扩增与更高的PD-L表达相关。值得注意的是,TMB表达与PD-L或CD8+ TIL阳性率均无相关性。TMB,CD8+ TIL和PD-L表达单一指标均不能预测预后,但是TMB联合PD-L或CD8+ TIL可以很好的预测预后。

研究结论:这是迄今为止样本量最大的关于中国肺鳞癌人群基因组突变特征及其与TMB,CD8+ TIL和PD-L表达关联分析研究。

肺癌原发灶和远处转移灶肿瘤新抗原的分布特征差异研究

研究背景:以新抗原为基础的肿瘤个体化疫苗治疗显示了非常强大的抗肿瘤效果。但是,我们目前还没有数据证实从原发灶获取的新抗原信息是否和远处转移灶存在异质性。

研究方法:4例患者的原发灶和匹配的远处转移灶及其外周血细胞在患者接受任何治疗以前搜集贮存。所有样本进行深度全外显子测序,新抗原定义为肿瘤特异性突变,倍数变化>0,具有MHC高亲和力(IC50 < 500 nM),预测肽段长度在9-个氨基酸。

研究结果:新抗原突变数目在原发灶和转移灶都有着非常广泛的分布。两者新抗原数目存在明显相关性。对新抗原分布进行标准化后发现,0%的新抗原同时存在于原发灶和转移灶(克隆性新抗原),进一步研究发现此类新抗原是肿瘤进化的必然结果。与原发灶相比,转移灶拥有更大比例的亚克隆性新抗原。亚克隆性新抗原的比例受到吸烟史、原发灶组织学类型和转移器官部位的影响。

研究结论:新抗原分布在原发灶和转移灶存在均为明显的异质性,这种异质性对后续肿瘤个体化疫苗治疗的影响需要进一步研究。(beplay.comBioon.com)

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